印加人吸收邻近民族的信仰，同时也将帝国本身的信仰加之于在这些民族。其结果是，部落性的神明变成从属于印加人的太阳神因蒂信仰。印加人相信一位不可见的、难以察觉的、无法想像的造物神毕拉哥洽（Viracocha）或帕洽卡马克（Pachacámac）。这位造物神在传说之中比太阳神及其他神明的地位还要高。

认为此神为一切权力之来源，无需为其划圣地，建神殿，仅有一人形金像。祈祷时，常先向韦拉可卡献上第一篇祷词，然后分别向日、雷、月、星及地母、海母祈祷。由于韦拉可卡的地位特别崇高，印加人平时求告的主要是其他一些较小的神灵，统称华卡。其中日神印蒂的地位最高，为各物神和印加王的祖先、保护者。其形象是一金制发光人脸，与雷电、气候神及月亮女神同住太阳神庙中，诸星神亦居于此庙。其中有的神被认为专管人间的一些特别事务，或照管一些有特别用途的动物。印加人还崇拜诸王的木乃伊，认为其具有超然的神力。祭祀常在室外举行。参加祭祀者应当洁净以符合礼仪，因此宗教活动往往伴以认罪、悔改、在活水中洗净身体等。神庙存放神像、圣器，祭司和“特选的妇女”亦居其中。祭典以供奉牺牲为主,通常的祭品是骆马、豚鼠和伊拉麻果(一种热带果品)。发生重大事件时（如印加王登基）,常将神庙中的特选妇女、战俘及儿童作牺牲祭神。有较为完善的教阶制度，祭司的等级分明并参预政治活动。大祭司为终身制，掌握实权,可婚娶,各地祭司皆由其任免。各地设有祭司学校。特选的妇女自幼在神庙培养，成年后或作帝王妻妾，或幽居神庙，需要时则作祭品献神。