贞元3年（978年），赖忠把女儿遵子送入圆融天皇后宫。同年八月，兼家也把次女藤原诠子送入圆融天皇后宫；此前她的同母姐姐藤原超子也已进入冷泉天皇后宫并生下三子一女。

天元二年（979年）六月三日，中宫媓子崩御。

天元三年（980年）一月，诠子获封从四位下，当时她已怀孕。而此时遵子因其父亲藤原赖忠担任关白的缘故，早已是从四位上。

虽然在地位上被遵子领先，但据《荣华物语》所说，诠子性格温婉，最受天皇宠爱。天皇只是因为赖忠是关白才重视遵子，其实喜欢的是诠子。于天元三年（980年）六月一日，诠子在父亲兼家的东三条邸生下圆融天皇第一皇子怀仁亲王。圆融天皇想看皇子，却因忌惮关白赖忠而未能成行。

后位空虚，诠子和遵子都想正位中宫。藤原兼家认为女儿生有皇嗣，必为中宫。然而天元五年（982年）三月十一日，在藤原赖忠的权力贯彻之下，无子的遵子被立为皇后，兼家的愿望落空了。从此之后，诠子和父亲住在一起，圆融天皇数次想见诠子，兼家都让诠子拒绝不见。同年怀仁亲王举行“袴着”仪式，诠子才终于回宫，但三日后就又离开了皇宫。

兼家暂落下风，但是女儿诠子所生的怀仁亲王为圆融天皇的独生子，在圆融天皇让位侄子花山天皇（冷泉天皇第一皇子）后，怀仁亲王被立为皇太子。兼家胜出的基础已经奠定。

永观二年（984年）八月二十七日，26岁的圆融天皇为了躲避藤原氏的争斗，决定让位给冷泉上皇的儿子。于是，师贞亲王继位为花山天皇。

宽和元年（985年）八月，圆融上皇出家为僧。

正历二年二月十二日（991年3月1日），圆融上皇崩御，享年33岁。

父亲：村上天皇

母亲：藤原安子（927—964）， 右大臣藤原师辅与正室藤原盛子（藤原经邦之女）的长女，村上天皇中宫；生有第一皇子（946，早夭），第一皇女承子内亲王（948—951），第二皇子宪平亲王（冷泉天皇）（950—1011），第四皇子为平亲王（952—1010，一品式部卿），第七皇女辅子内亲王（953—992，伊势斋宫），第九皇女资子内亲王（955—1015，一品准三宫），第七皇子守平亲王（959—991，圆融天皇），皇女（962，早夭），第十皇女选子内亲王（964—1035，大斋院）。

中宫

藤原媓子（947年—979年）：关白藤原兼通与能子女王（有明亲王之女）的长女；天禄四年（973年）入宫为女御，同年七月立为皇后；天元二年六月，崩于堀河邸，年三十三；世称“堀河中宫”。

藤原遵子（957年—1017年）：关白藤原赖忠与严子女王（代明亲王之女）的长女；天元元年（978年）入宫为女御，天元五年（982年）三月升为中宫，正历元年（990年）改册皇后，长德三年（997年）出家为尼，长保二年（1000年）尊为皇太后，长和元年（1012年）三条天皇即位后又升为太皇太后；宽仁元年（1017年）六月，逝世，享年六十六岁；遵子别称四条宫，也因为不曾怀孕而被时人称为“素腹后”。

女御

藤原诠子（962年—1001年）：关白藤原兼家与正室藤原时姬（藤原中正之女）的次女，同母兄藤原道隆、藤原道兼，同母弟藤原道长（诠子十分疼爱幼弟道长）；诠子生下圆融天皇的独生子怀仁亲王，即一条天皇；一条天皇即位时年仅六岁，诠子以国母权威干预政事，为藤原道长一门崛起的强大助力；诠子是日本历史上第一位女院，院号东三条院。

尊子内亲王（966—985）：冷泉天皇第二皇女，母为女御藤原怀子；曾担任贺茂斋院，后为圆融天皇女御；别称火之宫、承香殿女御。

更衣

中将御息所：藤原怀忠之女。

少将更衣

怀仁亲王（980—1011）：第一皇子，母为藤原诠子；怀仁是圆融天皇的独生子，后即位为第66代一条天皇。