其种类非常多，为方便起见，分为下列几类：（1）芳（香）基硫酸酯酶（arylsulfatase）（EC3．1．6．1）：一般作用于芳香硫酸酯的，如对硝基苯硫酸酯的酶。（2）甾类硫酸酯酶（Steroid Sulfatase）（EC3．1．6．2）：如作用于硫酸酯等的雄（甾）酮硫酸等甾类的酶。（3）葡糖硫酸酯酶（glycosulfatase）（EC3．1．6．3）：作用6-硫酸葡萄糖等的糖硫酸酯的酶。（4）芥子硫酸酯酶（myrosulfatase）：作用于黑芥子硫苷酸钾等的=N－O－SO3H键的酶。（5）胆碱硫酸酯酶（Choline sulfafase）（Ee3．1．6．6）：作用于硫酸胆碱的酶。（6）磺酰胺酯酶（sulfamatas）：作用于肝素的-NH－SO3H等的硫胺键的酶。特别是（1）和（2）的酶用于合成底物的研究较多。关于自然底物是什么？存在哪些种类的酶？尚有许多不清楚之处。但是，最近，在（1）的酶中有作用于天然硫酸（脑苷）脂（脂类的硫酸酯）和糖核苷（UDP－N-乙酰半乳糖胺-4-硫酸）的酶，另在（3）的酶中发现作用于硫酸软骨素B的艾杜糖醛酸的硫酸基的酶。此外还知道，有好几种遗传性疾病是由于缺少这些酶的缘故，并越来越认识到在生物体内硫酸酯代谢的重要性。