1994年5月16日，驻马店站客运站房开工。

1995年10月16日，驻马店站旅客出站地道开工。12月26日，驻马店站客运站房竣工。

1996年5月10日，驻马店站客运站房投入使用。10月15日，驻马店站旅客出站地道开通使用。

1997年7月21日，驻马店站采用IDM型售票微机发售各类客票。

1998年11月1日，驻马店站北配楼开工。

1999年10月15日，驻马店站北配楼竣工。

2000年5月16日，驻马店站由二等站晋升为一等乙级站，隶属郑州铁路局武汉铁路分局直接管理。

2002年8月，驻马店站分别在售票大厅、候车大厅、出站口和行李房等显要部位安装电子导向控制系统。9月25日，驻马店站晋升为一等甲级站。

2004年11月15日，驻马店站保留一等甲级客货中间站等级，不再由武汉铁路分局直管，归信阳车务段管理。

2005年3月18日，原属郑州铁路局的武汉铁路分局，升格为武汉铁路局，驻马店站改由武汉铁路局管理。4月8日，信阳车务段改为驻马店车务段，驻马店站归驻马店车务段管理。

2007年6月1日，驻马店站首次开行动车组列车。

2016年10月27日，驻马店站综合改扩建工程开工。

2017年5月24日，驻马店站停办旅客运输业务和行包运输业务。12月28日，驻马店站改造完毕并恢复办理客运业务。

驻马店站位于中国河南省驻马店市驿城区解放路1号，西临菜市街、东临南海路、北跨交通路、南跨解放大道，车站北距驻马店市人民政府约5千米，西距驻马店西站约8千米；驻马店站为京广铁路中间站，上行距大刘庄站8千米，下行距马庄站10千米。

驻马店站站房设计以“千年驿站”为主题，建筑形体上取古驿站的神韵，继续传递驿站精神。

截至2017年12月，驻马店站总建筑面积为11998平方米，可同时容纳4000人候车，门厅面积为360平方米，售票厅面积达264平方米；跨线天桥长40米、宽12米；站台长550米，两个站台面积分别为5700平方米、5775平方米，宽12米，风雨棚面积1.3万平方米。

驻马店站站房为线侧平式站房，地下一层、地上二层，局部设置夹层，采用上进下出旅客流线方式，进站口设有门厅，一层中部主要设置候车大厅及其它配套旅客服务设施，南侧设有售票厅、VIP候车室，夹层区域主要用于车站办公、设备用房等；二楼为候车大厅。

驻马店站站前广场地上为绿化及活动广场，地下为出租车、社会车辆停靠及部分商业设施，实现地上、地下人车分流。

截至2017年12月，驻马店站站台规模为2台9线，途经该站的铁路线路为京广铁路。

截至2017年12月，驻马店站售票大厅设有7个人工售票窗口，9台自动售（取）票机。

2020年6月20日，驻马店站实施电子客票，旅客乘车不需要再换取纸质车票，凭二代身份证直接刷证即可进站乘车。

截至2017年12月，驻马店站站房和站场内共设置8台电梯，其中扶梯6台、无障碍垂直电梯2台，最大限度减少旅客乘车行走距离；设有残疾人电梯、残疾人专用卫生间，站台等服务设施地面均设置盲道，售票厅内设残疾人购票通道，实现全方位无障碍进出站。

截至2017年12月，驻马店站在一楼候车厅设置“爱心母婴室”，内设沙发、茶几、婴儿床等设施，专门为母婴旅客提供私密、舒适的哺乳和候车空间。

截至2020年1月，驻马店站设有地下停车场，共有397个停车位，方便旅客乘车。

截至2023年6月，驻马店站主要办理旅客乘降等客运业务，办理行李包裹快运业务。

截至2023年6月，驻马店站货运主要办理整车、集装箱、批量零散快运业务，货场办理批量零散、超限、超载货运业务；专用线10条，办理粮食、化肥、煤、钢铁、农机等货运业务。

截至2012年，驻马店站主要年份运输生产指标统计如下：

截至2017年12月，驻马店站在候车厅一楼设置“驿路情深”总服务台，总服务台提供问询服务、挂失服务、助困服务、无障碍服务、失物招领服务、手机充电服务等多项内容。

据2023年7月驻马店公交官网数据，共有12条公交线路途经驻马店站。

截至2017年12月，驻马店站出站旅客可由地下通道进入驿城客运站。

截至2017年12月，驻马店站出站旅客可由地下通道进入出租车乘车区。

驻马店站扩建后，将成为驻马店市新的标志性建筑，彻底改变了老火车站及周边区域脏、乱、差现象，带动周边地区更新发展，改善旧城生活环境，繁荣火车站商贸经济，提升京广铁路驻马店站交通枢纽功能。（《驻马店日报》 评）

驻马店站新站房、新站场、新设备的投入使用，客运业务恢复办理，必将负担起新时代“交通强国、铁路先行”的历史使命，为广大旅客提供安全、方便、温馨的出行环境，促进驻马店市与国内外地区的经济文化交流，扮靓城市窗口，为驻马店经济社会发展提供强有力的运力支持。（映象网 评）